Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms