Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KHDC1Q4VXA5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms