Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC153Q494R4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms