Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP20-2Q3LI61 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms