Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms