Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TWISTNBQ3B726 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms