Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ODF4Q2M2E3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms