Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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RRN3P1Q2M238 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
RRN3P1Q2M238 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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