Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CA9Q16790 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CA9Q16790 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CA9Q16790 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CA9Q16790 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CA9Q16790 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CA9Q16790 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CA9Q16790 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CA9Q16790 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CA9Q16790 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CA9Q16790 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CA9Q16790 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CA9Q16790 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CA9Q16790 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CA9Q16790 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CA9Q16790 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CA9Q16790 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms