Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP2B3Q16720 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP2B3Q16720 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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