Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RPE65Q16518 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RPE65Q16518 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RPE65Q16518 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RPE65Q16518 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RPE65Q16518 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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RPE65Q16518 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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