Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA4Q16363 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
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