Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZIC1Q15915 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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