Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
USF2Q15853 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
USF2Q15853 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
USF2Q15853 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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