Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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EFNB3Q15768 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB3Q15768 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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