Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC1A5Q15758 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms