Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TLR1Q15399 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms