Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF4Q15306 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms