Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RAB35Q15286 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RAB35Q15286 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RAB35Q15286 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RAB35Q15286 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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RAB35Q15286 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB35Q15286 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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