Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDGFRLQ15198 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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