Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCOLCEQ15113 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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