Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NCF4Q15080 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NCF4Q15080 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
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