Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
BRD3Q15059 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
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