Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GPNMBQ14956 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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