Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GINS1Q14691 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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