Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF235Q14590 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF235Q14590 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms