Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEMA3AQ14563 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SEMA3AQ14563 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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SEMA3AQ14563 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEMA3AQ14563 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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