Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HNF4GQ14541 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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