Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PDE6HQ13956 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms