Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MTMR3Q13615 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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