Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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