Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
XRCC4Q13426 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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