Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
AP3B2Q13367 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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