Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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