Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CLN3Q13286 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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CLN3Q13286 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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CLN3Q13286 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CLN3Q13286 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CLN3Q13286 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CLN3Q13286 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CLN3Q13286 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CLN3Q13286 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CLN3Q13286 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLN3Q13286 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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