Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GPS1Q13098 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GPS1Q13098 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
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