Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
STRN3Q13033 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms