Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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PTPN13Q12923 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPN13Q12923 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPN13Q12923 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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