Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NIPAL4Q0D2K0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms