Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN5Q08AF3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN5Q08AF3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms