Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CYP4F3Q08477 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms