Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SRSF4Q08170 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRSF4Q08170 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms