Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TFF3Q07654 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms