Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms