Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EMX2Q04743 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms