Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP7AQ04656 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP7AQ04656 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms