Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NRG1Q02297 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRG1Q02297 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms