Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XPCQ01831 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XPCQ01831 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XPCQ01831 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XPCQ01831 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms