Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNA1BQ00975 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms