Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDK6Q00534 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK6Q00534 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms